БІОІНФОРМАТИЧНИЙ АНАЛІЗ КЛЮЧОВИХ ФАКТОРІВ РЕГУЛЯЦІЇ ЕКСПРЕСІЇ ЕЛАСТИНУ В УМОВНО НОРМАЛЬНІЙ ТА ЗЛОЯКІСНО ТРАНСФОРМОВАНІЙ ТКАНИНІ МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ
DOI:
https://doi.org/10.15407/oncology.2025.03.182Ключові слова:
рак молочної залози, екстрацелюлярний матрикс, еластин, ММР-14, прогресія злоякісних новоутворень, біоінформатичний аналізАнотація
Рак молочної залози (РМЗ) є одним із найпоширеніших онкологічних захворювань у жінок в усьому світі. Злоякісні новоутворення молочної залози належать до великої гетерогенної групи пухлин, що характеризуються спектром морфологічних ознак, молекулярних підтипів та ступенем агресивності перебігу пухлинного процесу. Сучасні дослідження акцентують увагу на епітеліальному компоненті пухлини та її мікрооточенні, зокрема на фібробластах, які формують позаклітинний матрикс і синтезують структурні волокна, серед яких еластин. Зміни в позаклітинному матриксі, такі як ремоделювання та деградація, що залежать від активності матриксних металопротеїназ (ММР), відіграють ключову роль у прогресуванні РМЗ. Мета: систематичний in silico аналіз показників експресії та ролі еластину (ELN) при РМЗ різних молекулярних підтипів, з акцентом на пов’язані з активністю MMP-14 регуляторні механізми. Об’єкт і методи: дослідження залежності рів- нів експресії ELN та MMP-14 в умовно нормальній тканині молочної залози та тканині РМЗ від клінічних характеристик та виживаності хворих проводили за допомогою онлайн-ресурсів UALCAN та KM-plotter. Результати: характерною ознакою РМЗ усіх молекулярних підтипів є зниження експресії ELN на рівні білка у пухлині порівняно з нормальною тканиною молочної залози. Достовірно менші показники експресії мРНК цього гену спостерігали у зразках РМЗ HER2-позитивного та тричі негативного молекулярних підтипів. Встановлено, що високий рівень експресії мРНК ELN асоціюється зі сприятливим клінічним перебігом РМЗ та вищими показниками безрецидивної виживаності пацієнток. Найбільш виражений ефект спостерігали у хворих із люмінальним А підтипом новоутворень, де рівень виживаності перевищував на 20% аналогічний показник у групі з низькою експресією ELN. Висновок: показники експресії ELN на рівні мРНК та білка можуть бути використані в якості прогностичних молекулярних маркерів у пацієнток з РМЗ різних молекулярних підтипів.
Посилання
Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al. Global cancer statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA: a cancer journal for clinicians 2021; 71 (3): 209–49. https://doi.org/10.3322/caac.21660.
Assi H A, Khoury K E, Dbouk H, et al. Epidemiology and prognosis of breast cancer in young women. Journal of thoracic disease 2013; 5 (1): S2–8. https://doi.org/10.3978
/j.issn.2072-1439.2013.05.24.
Bertos NR, Park M. Breast cancer — one term, many enti- ties? The Journal of clinical investigation 2011; 121 (10): 3789–96. https://doi.org/10.1172/JCI57100.
Berezhnaya NM, Chekhun VF. Physiological system of connective tissue and oncogenesis. I. The role of cellular components of the stroma in tumor development. Oncology 2016; 18 (1): 4–12.
Nissen N I, Karsdal M, Willumsen N. Collagens and cancer associated fi oblasts in the reactive stroma and its relation to cancer biology. J Exp Clin Cancer Res 2019; 38 (1): 115. https://doi.org/10.1186/s13046-019-1110-6.
Lukianova N, Zadvornyi T, Mushii О, et al. Evaluation of diagnostic algorithm based on collagen organization parameters for breast tumors. Exp Oncol 2022; 44 (4): 281–286. https://doi.org/10.32471/exp-oncology.2312-8852.vol-44- no-4.19137.
Toprak N, Aras І, Toktaş O, et al. Assessment of stromal elastin fibers in breast cancer and fibroadenomas: is there a correlation with ultrasound elastography findings? Eur J Breast Health 2022; 18 (2): 134–40. https://doi.org/10.4274/ejbh.galenos.2022.2021-8-3.
Naleskina L A, Kunska L M, Chekhun VF. Modern views on the role of main components of stroma and tumor microenvironment in invasion, migration and metastasis. Exp Oncol 2020; 42 (4): 252–62. https://doi.org/10.32471/exp-oncology.2312-8852.vol-42-no-4.15401.
Roy R, Yang J, Moses MA. Matrix metalloproteinases as novel biomarkers and potential therapeutic targets in human cancer. J Clin Oncol 2009; 27 (31): 5287–97. https://doi.org/10.1200/JCO.2009.23.5556.
Salesse S, Odoul L, Chazée L, et al. Elastin molecular aging promotes MDA-MB-231 breast cancer cell invasiveness. FEBS Open Bio 2018; 8 (9): 1395–404. https://doi.org/10. 1002/2211-5463.12455.
Chandrashekar D S, Bashel B, Balasubramanya S, et al. UALCAN: a portal for facilitating tumor subgroup gene expression and survival analyses. Neoplasia (New York) 2017; 19 (8): 649–58. https://doi.org/10.1016/j.neo.2017.05.002.
Györffy B, Lanczky A, Eklund AC, et al. An online survival analysis tool to rapidly assess the eff of 22,277 genes on breast cancer prognosis using microarray data of 1,809 patients. Breast Cancer Res Treat 2010; 123 (3): 725–31. https://doi.org/10.1007/s10549-009-0674-9.
Li J H, Liu S, Zhou H, et al. starBase v2.0: decoding miR- NA-ceRNA, miRNA-ncRNA and protein–RNA interaction networks from large-scale CLIP-Seq data. Nucleic Acids Res 2014; 42 (Database issue): D92–7. https://doi.org/10.1093/nar/gkt1248.
