ВПЛИВ COVID-19 ТА ВАКЦИНАЦІЇ ПРОТИ SARS-CoV-2 НА ПЕРЕБІГ ОНКОГЕМАТОЛОГІЧНИХ ЗАХВОРЮВАНЬ. 1. Генетичні характеристики варіантів вірусу SARS-CoV-2 при трьох хвилях пандемії в Україні
DOI:
https://doi.org/10.15407/oncology.2024.03.216Ключові слова:
COVID 19, SARS-CoV-2, генетичний матеріал, мутації, пандемія, злоякісне новоутворення, онкогематологічні захворюванняАнотація
В Україні COVID-19 вперше було діагностовано 3 березня 2020 р. в Чернівцях. На 13 квітня 2024 р. в Україні налічується 5 557 995 інфікованих осіб, з них померлих приблизно 2%. Наразі COVID-19 отримав статус сезонної хвороби, подібно до грипу. Найбільші хвилі епідемії спричинили штами SRAS-CoV-2 Alpha (вперше зареєстрований у Великобританії), Delta (вперше зареєстрований в Індії) та Omicron (вперше зареєстрований у Південній Африці). Невирішеними залишилися питання ведення онкологічних хворих з COVID-19, впливу вірусу SARS-CoV-2 на перебіг захворювання, необхідності вакцинації для запобігання COVID-19 на тлі онкологічних захворювань, тощо. Причому ризик летальних наслідків у онкогематологічних хворих в разі супутньої коронавірусної інфекції збільшується майже вдвічі. Слід зазначити, що на сьогодні немає маркерів (факторів), які б дозволили визначити чіткі рекомендації щодо продовження або відтермінування хіміотерапії на тлі COVID-19, особливо в разі наявності онкогематологічних захворювань. Без сумніву, такі дослідження повинні проводитися, щоби підвищити загальну виживаність і якість життя хворих на злоякісні новоутворення.
Посилання
Masters PS. The molecular biology of coronaviruses. Adv Virus Res 2006; 66: 193–292. doi: 10.1016/S0065-3527(06)66005-3.
Bai Z, Cao Y, Liu W, Li J. The SARS-CoV-2 nucleocapsid protein and its role in viral structure, biological functions, and a potential target for drug or vaccine mitigation. Viruses 2021; 13 (6): 1115. doi: 10.3390/v13061115.
Santos-Mendoza T. The envelope (E) protein of SARS-CoV-2 as a pharmacological target. Viruses 2023; 15 (4):1000. doi: 10.3390/v15041000.
Cao Y, Yang R, Lee I, et al. Characterization of the SARS-CoV-2 E protein: sequence, structure, viroporin, and inhibitors. Protein Sci 2021; 30 (6): 1114–30. doi: 10.1002/pro.4075.
Schoeman D, Fielding BC. Coronavirus envelope protein: current knowledge. Virol J 2019; 16 (1): 69. doi: 10.1186/s12985-019-1182-0.
Boson B, Legros V, Zhou B, et al. The SARS-CoV-2 envelope and membrane proteins modulate maturation and retention of the spike protein, allowing assembly of virus-like particles. J Biol Chem. 2021; 296: 100111. doi: 10.1074/jbc.RA120.016175.
V’Kovski P, Kratzel A, Steiner S, et al. Coronavirus biology and replication: implications for SARS-CoV-2. Nat Rev Microbiol 2021; 19 (3): 155–70. doi: 10.1038/s41579-020-00468-6.
Bai C, Zhong Q, Gao GF. Overview of SARS-CoV-2 genome-encoded proteins. Sci China Life Sci 2022; 65 (2): 280–94. doi: 10.1007/s11427-021-1964-4.
Naqvi AAT, Fatima K, Mohammad T, et al. Insights into SARS-CoV-2 genome, structure, evolution, pathogenesis and therapies: Structural genomics approach. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis 2020; 1866 (10): 165878. doi: 10.1016/j.bbadis.2020.165878.
Voelkerding KV, Dames SA, Durtschi JD. Next-generation sequencing: from basic research to diagnostics. Clin Chem 2009; 55 (4): 641–58. doi: 10.1373/clinchem.2008.112789.
Wang MY, Zhao R, Gao LJ, et al. SARS-CoV-2: Structure, biology, and structure-based therapeutics development. Front Cell Infect Microbiol 2020; 10: 587269. doi: 10.3389/fcimb.2020.587269.
Lauring AS, Hodcroft EB. Genetic variants of SARS-CoV-2-what do they mean? JAMA 2021; 325 (6): 529–31. doi: 10.1001/jama.2020.27124.
Thakur S, Sasi S, Pillai SG, et al. SARS-CoV-2 mutations and their impact on diagnostics, therapeutics and vaccines. Front Med (Lausanne) 2022; 9: 815389. doi: 10.3389/fmed.2022.815389.
Chavda VP, Patel AB, Vaghasiya DD. SARS-CoV-2 variants and vulnerability at the global level. J Med Virol 2022; 94 (7): 2986–3005. doi: 10.1002/jmv.27717.
Earnest R, Uddin R, Matluk N, et al. Comparative transmissibility of SARS-CoV-2 variants Delta and Alpha in New England, USA. Cell Rep Med 2022; 3 (4): 100583. doi: 10.1016/j.xcrm.2022.100583.
Nyberg T, Ferguson NM, Nash SG, et al. Comparative analysis of the risks of hospitalisation and death associated with SARS-CoV-2 omicron (B.1.1.529) and delta (B.1.617.2) variants in England: a cohort study. Lancet 2022; 399 (10332): 1303–12. doi: 10.1016/S0140-6736(22)00462-7.
Gerashchenko GV, Hryshchenko NV, Melnichuk NS, et al. Genetic characteristics of SARS-CoV-2 virus variants observed upon three waves of the COVID-19 pandemic in Ukraine between February 2021-January 2022. Heliyon 2024; 10 (4): e25618. doi: 10.1016/j.heliyon.2024.e25618.
Lubinski B, Frazier LE, Phan MVT, et al. Spike protein cleavage-activation in the context of the SARS-CoV-2 P681R mutation: An analysis from its first appearance in lineage A.23.1 identified in Uganda. Microbiol Spectr 2022; 10 (4): e0151422. doi: 10.1128/spectrum.01514-22.
Meng B, Abdullahi A, Ferreira I, et al. Altered TMPRSS2 usage by SARS-CoV-2 Omicron impacts infectivity and fusogenicity. Nature 2022; 603 (7902): 706–14. doi: 10.1038/s41586-022-04474-x.
Tanaka H, Ogata T, Shibata T, et al. Shorter incubation period among COVID-19 cases with the BA.1 Omicron variant. Int J Environ Res Public Health 2022; 19 (10): 6330. doi: 10.3390/ijerph19106330.
Backer JA, Eggink D, Andeweg SP, et al. Shorter serial intervals in SARS-CoV-2 cases with Omicron BA.1 variant compared with Delta variant, the Netherlands, 13 to 26 December 2021. Euro Surveill 2022; 27 (6): 2200042. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2022.27.6.2200042.
Vijenthira A, Gong IY, Fox TA, et al. Outcomes of patients with hematologic malignancies and COVID-19: a systematic review and meta-analysis of 3377 patients. Blood 2020; 136 (25): 2881–92. doi: 10.1182/blood.2020008824.
Al-Quteimat OM, Amer AM. The impact of the COVID-19 pandemic on cancer patients. Am J Clin Oncol 2020; 43 (6): 452–5. doi: 10.1097/COC.0000000000000712.
