Кладистичний аналіз серин-треонінової протеїнкінази KIN10 та особливості її експресії в різних органах Arabidopsis thaliana

Автор(и)

  • О. Є. Краснопьорова ДУ “Iнститут харчової бiотехнологiї та геномiки НАН України”, Київ
  • С. В. Iсаєнков ДУ “Iнститут харчової бiотехнологiї та геномiки НАН України”, Київ
  • П. А. Карпов ДУ “Iнститут харчової бiотехнологiї та геномiки НАН України”, Київ
  • А. I. Ємець ДУ “Iнститут харчової бiотехнологiї та геномiки НАН України”, Київ
  • Я. Б. Блюм ДУ “Iнститут харчової бiотехнологiї та геномiки НАН України”, Київ

DOI:

https://doi.org/10.15407/dopovidi2016.01.081

Ключові слова:

KIN10, експресія генів, кладистичний аналіз, найближчі гомологи, серин-треонінові протеїнкінази, філогенетичне дерево

Анотація

Проведено кладистичний аналіз та побудовано філогенетичне дерево найближчих гомологів протеїнкінази KIN10 із Arabidopsis thaliana. Показано, що KIN10 і її два найближчих гомолога в рослинах A. thaliana: KIN11 (P92958) та Akin11 (Q9FLZ3) є представниками унікальної підродини рослинних протеїнкіназ SnRK1. Охарактеризовано експресію KIN10 в різних органах рослин A. thaliana. Найбільшу кількість транскриптів KIN10 відмічено в наземній фотосинтезуючій частині рослин, де протеїнкіназа KIN10 забезпечує регуляцію біосинтетичних та різноманітних сигнальних процесів.

Завантаження

Дані завантаження ще не доступні.

Посилання

Mohannath G., Jackel J. N., Lee Y. H., Buchmann C., Wang H., Patil V., Adams A. K., Bisar D. M. PLoS One, 2014, 9, No 1: e87592. doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0087592, PMid:24498147 PMCid:PMC3907550

Halford N. G., Hey S., Jhurreea D., Laurie S., McKibbin R. S., Paul M., Zhang Y. J. Exp. Bot., 2003, 54: 467–475. doi: https://doi.org/10.1093/jxb/erg038, PMid:12508057

Halford N. G., Hardie D. G. Plant Mol. Biol., 1998, 37: 735–748. doi: https://doi.org/10.1023/A:1006024231305, PMid:9678569

Son S., Oh C.J., An C.S. Plant Pathol. J., 2014, 30, Iss. 3: 269–278. doi: https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.06.2014.0061, PMid:25289013 PMCid:PMC4181108

Baena-González E., Sheen J. Trends Plant Sci., 2008, 9: 474–482. doi: https://doi.org/10.1016/j.tplants.2008.06.006, PMid:18701338 PMCid:PMC3075853

Lawlor D. W., Paul M. J. Front. Plant Sci., 2014, 5: 418–432. doi: https://doi.org/10.3389/fpls.2014.00418, PMid:25202319 PMCid:PMC4142875

Nunes C., O'Hara L. E., Primavesi L. F., Delatte T. L., Schluepmann H., Somsen G. W., Silva A. B., Fevereiro P. S., Wingler A., Paul M. J. Plant Physiol., 2013, 162, No 3: 1720–1732. doi: https://doi.org/10.1104/pp.113.220657, PMid:23735508 PMCid:PMC3707538

Jeong E.-Y., Seo P. J., Woo J. C., Park C.-M. BMC Plant Biol., 2015, 15, No 1: 110–123. doi: https://doi.org/10.1186/s12870-015-0503-8, PMid:25929516 PMCid:PMC4416337

Fragoso S., Espíndola L., Páez-Valencia J., Gamboa A., Camacho Y., Martínez-Barajas E., Coello P. Plant Physiol., 2009, 149, No 4: 1906–1916. doi: https://doi.org/10.1104/pp.108.133298, PMid:19211700 PMCid:PMC2663738

Karpov P. A., Nadezhdina E. S., Yemets A. I., Blume Ya. B. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull., 2010, 65: 213–216. doi: https://doi.org/10.3103/S0096392510040267

Kjaersgârd I. V., Jespersen H. M., Rasmussen S. K., Welinder K. G. Plant Mol. Biol., 1997, 33, No 4: 699–708. doi: https://doi.org/10.1023/A:1005707813801, PMid:9132061

Sato S., Kaneko T., Kotani H., Nakamura Y., Asamizu E., Miyajima N., Tabata S. DNA Res., 1998, 5: 41–54. doi: https://doi.org/10.1093/dnares/5.1.41, PMid:9628582

Littler D. R., Walker J. R., Davis T., Wybenga-Groot L. E., Finerty PJ. Jr., Newman E., Mackenzie F., Dhe-Paganon S. Acta. Crystallogr. Sect. F. Struct. Biol. Cryst. Commun., 2010, 66: 143–151. doi: https://doi.org/10.1107/S1744309109052543, PMid:20124709 PMCid:PMC2815679

Bright N. J., Carling D., Thornton C. J. Biol. Chem., 2008, 22: 14946–14954. doi: https://doi.org/10.1074/jbc.M710381200, PMid:18339622 PMCid:PMC3258900

Matenia D., Mandelkow E. M. Trends Biochem. Sci., 2009: 34: 332–342. doi: https://doi.org/10.1016/j.tibs.2009.03.008, PMid:19559622

##submission.downloads##

Опубліковано

29.09.2024

Як цитувати

Краснопьорова, О. Є., Iсаєнков С. В., Карпов, П. А., Ємець А. I., & Блюм, Я. Б. (2024). Кладистичний аналіз серин-треонінової протеїнкінази KIN10 та особливості її експресії в різних органах Arabidopsis thaliana . Доповіді Національної академії наук України, (1), 81–91. https://doi.org/10.15407/dopovidi2016.01.081

Номер

№ 1 (2016): Доповіді Національної академії наук України

Розділ

Біологія

Ліцензія

Авторське право (c) 2024 Доповіді Національної академії наук України

Creative Commons License

Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

Статті цього автора (авторів), які найбільше читають