Поліморфізм довжини інтронів генів тубуліну як ефективний інструмент генетичної диференціації рослин

За матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 15 вересня 2021 року

Автор(и)

  • Анастасія Миколаївна Рабоконь кандидат біологічних наук, науковий співробітник відділу популяційної генетики Державної установи «Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України» https://orcid.org/0000-0002-6249-1824

DOI:

https://doi.org/10.15407/visn2021.10.030

Ключові слова:

молекулярно-генетичні маркери, тубулін, ТВР, ген, поліморфізм довжини інтронів, генетична диференціація, генотип, сорт, популяція, вид

Анотація

Проведено дослідження можливості та ефективності застосування маркерної системи оцінки поліморфізму довжини інтронів генів β-тубуліну (Tubulin Base Polymorphism — ТВР) для молекулярно-генетичного диференціювання рослин на рівні генотипів (сортів), популяцій та видів, зокрема сортів пшениці м’якої, ячменю звичайного, рижію посівного та льону-довгунцю, острівних популяцій щучника антарктичного, кримських популяцій егілопсу, а також видів льону, елевсини та підвидів омели білої. Отримані результати дозволяють рекомендувати ТВР-метод для використання в молекулярній генетиці рослин для аналізу на всіх таксономічних рівнях, а також для цілеспрямованого застосування в молекулярній селекції.

Посилання

Poczai P., Varga I., Laos M., Cseh A., Bell N., Valkonen J.P.T., Hyvönen J. Advances in plant gene-targeted and functional markers: a review. Plant Methods. 2013. 9: 6. DOI: https://doi.org/10.1186/1746-4811-9-6

Yang L., Jin G., Zhao X., Zheng Y., Xu Z., Wu W. PIP: a database of potential intron polymorphism markers. Bioinformatics. 2007. 23(16): 2174—2177. DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm296

Rabokon A., Pirko Ya., Demkovych A., Blume Ya. Intron length polymorphism of beta-tubulin genes as an effective instrument for plant genotyping. Mol. Appl. Genetics (Minsk). 2015. 19: 35—44 (in Russian).

Rabokon A.N., Demkovich A.E., Pirko Ya.V., Blume Ya.B. Studing of β-tubulin gene intron length polymorphizm of Triticum aestivum L. and Hordeum vulgare L. varieties. Factors Exp. Evol. Organisms. 2015. 17: 82—86 (in Ukrainian).

Blume R.Y., Rabokon A.M., Postovoitova A.S., Demkovich A.Ye., Pirko Ya.V., Yemets A.I., Rakhmetov D.B., Blume Ya.B. Evaluating the diversity and breeding prospects of Ukrainian spring Camelina genotypes. Cytol. Genet. 2020. 54(5): 54—74. DOI: https://doi.org/1 0.3103/S0095452720050084

Rabokon A.N., Pirko Ya.V., Demkovych A.Ye., Blume Ya.B. Comparative analysis of the efficiency of intron-length polymorphism of β-tubulin genes and microsatellite loci for flax varieties genotyping. Cytol. Genet. 2018. 52(1): 3—15. DOI: https://doi.org/10.3103/S0095452718010115

Rabokon A.M., Pirko Y.V., Demkovych A.Ye., Andreev I.O., Parnikoza I.Yu., Kozeretska I.A., Yu Z., Kunakh V.A., Blume Y.B. Intron length polymorphism of β-tubulin genes in Deschampsia antarctica E. Desv. across the western coast of the Antarctic Peninsula. Polar Science. 2018. DOI: https://doi.org/10.1016/j.polar. 2018.11.001

Rabokon A., Demkovich A., Sozinov A., Kozub N., Pirko Ya., Blume Ya. Intron length polymorphism of β-tubulin genes of Aegilops biuncialis Vis. Cell Biol. Int. 2017. DOI: https://doi.org/10.1002/cbin.10886

Bilonozhko Yu.O., Rabokon A.M., Postovoitova A.S., Kalafat L.O., Privalikhin S.M., Demkovych A.E., Blume Ya.B., Pirko Ya.V. Intraspecific differentiation of white mistletoe (Viscum album L.) by assessment of intron length polymorphism of β-tubulin genes and SSR-analysis. Cytol. Genet. 2021. 55(1): 1—9. DOI: https://doi.org/10.3103/S0095452721010035

Pirko Y.V., Rabokon A.M., Postovoytova A.S., Blume Y.B. New approaches in plant genotyping. In: National Academy of Sciences of Ukraine: on the results of 2018. Kyiv, 2019. P. 17—18. (in Ukrainian)

##submission.downloads##

Опубліковано

2021-10-21

Як цитувати

Рабоконь, А. М. (2021). Поліморфізм довжини інтронів генів тубуліну як ефективний інструмент генетичної диференціації рослин: За матеріалами наукового повідомлення на засіданні Президії НАН України 15 вересня 2021 року. Visnik Nacional Noi Academii Nauk Ukrai Ni, (10), 30–35. https://doi.org/10.15407/visn2021.10.030