Квантово-хiмiчний аналiз усiх можливих пар основ ДНК m1Thy · m9Ade
DOI:
https://doi.org/10.15407/dopovidi2014.07.158Ключові слова:
Квантово-хiмiчний аналiз усiх можливих пар основ ДНКАнотація
Вперше квантово-хiмiчними методами на рiвнi теорiї MP2/6-311++G(2df,pd)//B3LYP/ 6-311++G(d,p) отримано повне сiмейство воднево-зв’язаних пар основ ДНК m1Thy · m9Ade, метильованих за глiкозидним атомом азоту, яке нараховує 32 структури. Встановлено, що хугстинiвська пара вiдповiдає глобальному мiнiмуму вiльної енергiї Гiббса, поруч з яким у дiапазонi енергiй 0–1,20 ккал/моль знаходяться ще три локальних мiнiмуми обернена хугстинiвська, вотсон-крикiвська та обернена вотсон-крикiвська пара. Їхня сумарна заселенiсть за нормальних умов становить 99,9%.
Завантаження
Посилання
Brovarets O. O. Ukr. biokhim. zhurn., 2013, 85, No. 4: 104–110 (in Ukrainian).
Brovarets O. O., Hovorun D. M. Ukr. bioorgan. acta., 2010, No. 1: 11–17 (in Ukrainian).
Sukhodub L. F. Chem. Rev., 1987, 87, No. 3: 589–606. https://doi.org/10.1021/cr00079a006
Brovarets O. O., Hovorun D. M. J. Biomol. Struct. Dyn., to appear. doi: https://doi.org/10.1080/07391102.2013.852133.
Nedderman A. N. R., Stone M. J., Williams D. H. et al. J. Mol. Biol., 1993, 230, No. 3: 1068–1076. https://doi.org/10.1006/jmbi.1993.1219
Petrushka J., Sowers L. C., Goodman M. F. J. Mol. Biol., 1986, 83: 1559–1562.
Frisch M. J., Trucks G.W., Schlegel H. B., Scuseria G. E., Robb M. A., Cheeseman J. R., Montgomery J. A., Vreven T., Kudin K. N., Burant J. C., Millam J. M., Iyengar S. S., Tomasi J., Barone V., Mennucci B., Cossi M., Scalmani G., Rega N., Petersson G. A., Nakatsuji H., Hada M., Ehara M., Toyota K., Fukuda R., Hasegawa J., Ishida M., Nakajima T., Honda Y., Kitao O., Nakai H., Klene M., Li X., Knox J. E., Hratchian H. P., Cross J. B., Bakken V., Adamo C., Jaramillo J., Gomperts R., Stratmann R. E., Yazyev O.,. Austin A. J, Cammi R., Pomelli C., Ochterski J. W., Ayala P. Y., Morokuma K., Voth G. A., Salvador P., Dannenberg J. J., Zakrzewski V. G., Dapprich S., Daniels A. D., Strain M. C., Farkas O., Malick D. K., Rabuck A. D., Raghavachari K., Foresman J. B., Ortiz J. V., Cui Q., Baboul A. G., Clifford S., Cioslowski J., Stefanov B. B., Liu G., Liashenko A., Piskorz P., Komaromi I., Martin R. L., Fox D. J., Keith T., Al-Laham M. A., Peng C. Y., Nanayakkara A., Challacombe M., Gill P.M. W., Johnson, Chen W., Wong M. W., Gonzalez C., Pople J. A. Gaussian 03, Revision C. 02. Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004.
Bader R. W. F. Atoms in molecules. A quantum theory. Oxford: Calendon Press, 1990.
Sokolov N. D., Chulanovskyi V. M. (Eds.). Hydrogen Communications. Moscow: Nauka, 1964 (in Russian).
Keith T. A. AIMAll (Version 10.05.04), 2010 Retrieved from http://aim.tkgristmill.com.
Grunenberg J., Barone G. Royal Society of Chem., 2013, No. 3: 4757–4762.
Weinhold F., Landis C. R. Chem. Educ. Res. Pract. Eur., 2001, No. 2: 91–104.
Iogansen A. V. Spectrochim. Acta. Part A., 1999, 55: 1585–1612. https://doi.org/10.1016/S1386-1425(98)00348-5
Espinosa E., Alkorta I., Rozas I., Elguero J., Molins E. Chem. Phys. Lett., 2001, 336, No. 5–6: 457–461. https://doi.org/10.1016/S0009-2614(01)00178-6
##submission.downloads##
Опубліковано
Як цитувати
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2025 Доповіді Національної академії наук України
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
